MiRNA expression as outcome predictor in pediatric AML: systematic evaluation of a new model.
Autores: Ellson I, Martorell-Marugán J, Carmona-Sáez P, Ramos-Mejia V
08/2024 - NPJ genomic medicine
No se ha encontrado investigadores para este término.
Omics technologies and new experimental techniques allow the simultaneous quantification of thousands of biological variables and generate large volumes of data.
This amount of information necessitates the use of appropriate analysis techniques to handle and extract knowledge from these massive datasets.
Inicio - Área de Medicina Personalizada - Detección, Diagnóstico, Seguimiento y Pronóstico de Enfermedades - Bioinformatics and Health Data Science
Omics technologies enable the simultaneous quantification of thousands of biological variables, generating large volumes of data. This wealth of information necessitates the use of advanced analytical techniques to manage and extract meaningful knowledge from these extensive datasets. Our primary research focus is on developing and applying novel computational and statistical methods for the integration and analysis of multi-omics and biomedical data, aiming to enhance our understanding of the molecular mechanisms underlying complex diseases and to advance their diagnosis and treatment. Specifically, we concentrate on the following research areas:
Methods for Integrated Analysis of Biomedical Data
The rapid growth of omics techniques has resulted in an explosion of data available in public repositories, offering an invaluable resource for generating new knowledge and hypotheses. Within our group, we develop innovative methods and software tools for data integration, with a particular emphasis on multi-omics data fusion.
Our primary goal is to establish molecular signatures for patient classification and to create predictive models that assist in forecasting treatment responses or prognoses in complex pathologies. This work also incorporates information from electronic medical records. In this context, we actively collaborate with other research groups specializing in autoimmune diseases and cancer.
Development of Software and Bioinformatic Analysis Tools
One of our key objectives is to develop open-source applications that make our methodologies accessible to the scientific community. These applications include tools for data integration and functional analysis, which are widely utilized by researchers worldwide. A complete list of the software we have developed is available at https://compbio.ugr.es/tools/.
The generation of massive data in health and life sciences necessitates the development of advanced techniques for managing and analyzing complex, high-dimensional datasets, ensuring the effective implementation of precision medicine strategies. Our multidisciplinary research focuses on providing novel tools for extracting actionable information to aid in patient classification and disease prognosis modeling. Some of our methodologies have been implemented in open-source software packages, which are widely used by research groups worldwide to extract insights from biomedical data and generate new knowledge across diverse fields.
Our expertise promote engagement in collaborative projects with other researchers to address complex challenges with a strong inter- and multidisciplinary science component. We actively collaborate with other groups in GENyO and participate in different bioinformatics networks and consortia that enhance the center’s national and international visibility in these areas, such as TransBionet (Translational Bioinformatics Network). We are committed to maintaining high criteria of excellence and quality in our scientific production, aligned with the center.
Autores: Ellson I, Martorell-Marugán J, Carmona-Sáez P, Ramos-Mejia V
08/2024 - NPJ genomic medicine
Autores: López-Domínguez R, Villatoro-García JA, Marañón C, Goldman D, Petri M, Carmona-Sáez P, Alarcón-Riquelme M, Toro-Dominguez D
01/2024 - Research square
Autores: Toro-Domínguez D, Martorell-Marugán J, Martinez-Bueno M, López-Domínguez R, Carnero-Montoro E, Barturen G, Goldman D, Petri M, Carmona-Sáez P, Alarcón-Riquelme ME
11/2023 - Briefings in bioinformatics
Autores: Erawijantari PP, Kartal E, Liñares-Blanco J, Laajala TD, Feldman LE, FINRISK Microbiome DREAM Challenge and ML4Microbiome Communities, Carmona-Saez P, Shigdel R, Claesson MJ, Bertelsen RJ, Gomez-Cabrero D, Minot S, Albrecht J, Chung V, Inouye M, Jousilahti P, Schultz JH, Friederich HC, Knight R, Salomaa V, Niiranen T, Havulinna AS, Saez-Rodriguez J, Levinson RT, Lahti L
10/2023 - medRxiv : the preprint server for health sciences
Autores: Villatoro-García JA, López-Domínguez R, Martorell-Marugán J, Luna JD, Lorente JA, Carmona-Sáez P
11/2023 - The Science of the total environment
Autores: Domingo-Reinés J, Montes R, Garcia-Moreno A, Gallardo A, Sanchez-Manas JM, Ellson I, Lamolda M, Calabro C, López-Escamez JA, Catalina P, Carmona-Sáez P, Real PJ, Landeira D, Ramos-Mejia V
06/2023 - Cell death & disease
Autores: Asenjo HG, Alcazar-Fabra M, Espinosa-Martínez M, Lopez-Onieva L, Gallardo A, Dimitrova E, Feldmann A, Pachano T, Martorell-Marugán J, Carmona-Sáez P, Sanchez-Pozo A, Rada-Iglesias Á, Klose RJ, Landeira D
01/2023 - Nature communications
Autores: Martorell-Marugán J, Chierici M, Jurman G, Alarcón-Riquelme ME, Carmona-Sáez P
01/2023 - Computers in biology and medicine
Autores: Fernandez-Jimenez N, Fore R, Cilleros-Portet A, Lepeule J, Perron P, Kvist T, Tian FY, Lesseur C, Binder AM, Lozano M, Martorell-Marugán J, Loke YJ, Bakulski KM, Zhu Y, Forhan A, Sammallahti S, Everson TM, Chen J, Michels KB, Belmonte T, Carmona-Sáez P, Halliday J, Daniele Fallin M, LaSalle JM, Tost J, Czamara D, Fernández MF, Gómez-Martín A, Craig JM, Gonzalez-Alzaga B, Schmidt RJ, Dou JF, Muggli E, Lacasaña M, Vrijheid M, Marsit CJ, Karagas MR, Räikkönen K, Bouchard L, Heude B, Santa-Marina L, Bustamante M, Hivert MF, Bilbao JR
11/2022 - Communications biology
Autores: Femia P, Melchor J, Carmona-Saez P
08/2022 - Frontiers in physiology
Autores: Toro-Domínguez D, Martorell-Marugán J, Martinez-Bueno M, López-Domínguez R, Carnero-Montoro E, Barturen G, Goldman D, Petri M, Carmona-Sáez P, Alarcón-Riquelme ME
09/2022 - Briefings in bioinformatics
Autores: Gallardo A, Molina A, Asenjo HG, Lopez-Onieva L, Martorell-Marugán J, Espinosa-Martinez M, Griñan-Lison C, Alvarez-Perez JC, Cara FE, Navarro-Marchal SA, Carmona-Sáez P, Medina PP, Marchal JA, Granados-Principal S, Sánchez-Pozo A, Landeira D
07/2022 - Oncogene
Autores: Aparicio-Puerta E, Gómez-Martín C, Giannoukakos S, Medina JM, Scheepbouwer C, García-Moreno A, Carmona-Saez P, Fromm B, Pegtel M, Keller A, Marchal JA, Hackenberg M
07/2022 - Nucleic acids research
Autores: Garcia-Moreno A, López-Domínguez R, Villatoro-García JA, Ramirez-Mena A, Aparicio-Puerta E, Hackenberg M, Pascual-Montano A, Carmona-Saez P
03/2022 - Biomedicines
Autores: Pozo-Agundo A, Villaescusa N, Martorell-Marugán J, Soriano O, Leyva S, Jódar-Reyes AB, Botella LM, Carmona-Sáez P, Blanco FJ
08/2021 - International journal of molecular sciences
Autores: Everson TM, Vives-Usano M, Seyve E, Cardenas A, Lacasaña M, Craig JM, Lesseur C, Baker ER, Fernandez-Jimenez N, Heude B, Perron P, Gónzalez-Alzaga B, Halliday J, Deyssenroth MA, Karagas MR, Íñiguez C, Bouchard L, Carmona-Sáez P, Loke YJ, Hao K, Belmonte T, Charles MA, Martorell-Marugán J, Muggli E, Chen J, Fernández MF, Tost J, Gómez-Martín A, London SJ, Sunyer J, Marsit CJ, Lepeule J, Hivert MF, Bustamante M
08/2021 - Nature communications
Autores: Martorell-Marugán J, Carmona-Sáez P
06/2021 - Bio-protocol
Autores: Peinado P, Andrades A, Martorell-Marugán J, Haswell JR, Slack FJ, Carmona-Sáez P, Medina PP
11/2021 - Human molecular genetics
Autores: Martorell-Marugán J, López-Domínguez R, García-Moreno A, Toro-Domínguez D, Villatoro-García JA, Barturen G, Martín-Gómez A, Troule K, Gómez-López G, Al-Shahrour F, González-Rumayor V, Peña-Chilet M, Dopazo J, Sáez-Rodríguez J, Alarcón-Riquelme ME, Carmona-Sáez P
06/2021 - BMC bioinformatics
Autores: Lopez-Dominguez R, Toro-Dominguez D, Martorell-Marugan J, Garcia-Moreno A, Holland CH, Saez-Rodriguez J, Goldman D, Petri MA, Alarcon-Riquelme ME, Carmona-Saez P
04/2021 - Life (Basel, Switzerland)
Autores: Barturen G, Babaei S, Català-Moll F, Martínez-Bueno M, Makowska Z, Martorell-Marugán J, Carmona-Sáez P, Toro-Domínguez D, Carnero-Montoro E, Teruel M, Kerick M, Acosta-Herrera M, Le Lann L, Jamin C, Rodríguez-Ubreva J, García-Gómez A, Kageyama J, Buttgereit A, Hayat S, Mueller J, Lesche R, Hernandez-Fuentes M, Juarez M, Rowley T, White I, Marañón C, Gomes Anjos T, Varela N, Aguilar-Quesada R, Garrancho FJ, López-Berrio A, Rodriguez Maresca M, Navarro-Linares H, Almeida I, Azevedo N, Brandão M, Campar A, Faria R, Farinha F, Marinho A, Neves E, Tavares A, Vasconcelos C, Trombetta E, Montanelli G, Vigone B, Alvarez-Errico D, Li T, Thiagaran D, Blanco Alonso R, Corrales Martínez A, Genre F, López Mejías R, Gonzalez-Gay MA, Remuzgo S, Ubilla Garcia B, Cervera R, Espinosa G, Rodríguez-Pintó I, De Langhe E, Cremer J, Lories R, Belz D, Hunzelmann N, Baerlecken N, Kniesch K, Witte T, Lehner M, Stummvoll G, Zauner M, Aguirre-Zamorano MA, Barbarroja N, Castro-Villegas MC, Collantes-Estevez E, de Ramon E, Díaz Quintero I, Escudero-Contreras A, Fernández Roldán MC, Jiménez Gómez Y, Jiménez Moleón I, Lopez-Pedrera R, Ortega-Castro R, Ortego N, Raya E, Artusi C, Gerosa M, Meroni PL, Schioppo T, De Groof A, Ducreux J, Lauwerys B, Maudoux AL, Cornec D, Devauchelle-Pensec V, Jousse-Joulin S, Jouve PE, Rouvière B, Saraux A, Simon Q, Alvarez M, Chizzolini C, Dufour A, Wynar D, Balog A, Bocskai M, Deák M, Dulic S, Kádár G, Kovács L, Cheng Q, Gerl V, Hiepe F, Khodadadi L, Thiel S, de Rinaldis E, Rao S, Benschop RJ, Chamberlain C, Dow ER, Ioannou Y, Laigle L, Marovac J, Wojcik J, Renaudineau Y, Borghi MO, Frostegård J, Martín J, Beretta L, Ballestar E, McDonald F, Pers JO, Alarcón-Riquelme ME
06/2021 - Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
Autores: Garcia-Moreno A, Carmona-Saez P
08/2020 - Biomolecules
Autores: Martorell-Marugán J, Villatoro-García JA, García-Moreno A, López-Domínguez R, Requena F, Merelo JJ, Lacasaña M, de Dios Luna J, Díaz-Mochón JJ, Lorente JA, Carmona-Sáez P
01/2021 - The Science of the total environment
Autores: Troulé K, López-Fernández H, García-Martín S, Reboiro-Jato M, Carretero-Puche C, Martorell-Marugán J, Martín-Serrano G, Carmona-Sáez P, Glez-Peña D, Al-Shahrour F, Gómez-López G
05/2021 - Bioinformatics (Oxford, England)
Autores: Lopez-Caraballo L, Martorell-Marugan J, Carmona-Sáez P, Gonzalez-Munoz E
07/2020 - Cells
Autores: Lopez-Caraballo L, Martorell-Marugan J, Carmona-Saez P, Gonzalez-Muñoz E
08/2020 - iScience
Autores: Gallardo A, Molina A, Asenjo HG, Martorell-Marugán J, Montes R, Ramos-Mejia V, Sanchez-Pozo A, Carmona-Sáez P, Lopez-Onieva L, Landeira D
04/2020 - Life science alliance
Autores: Peris-Torres C, Plaza-Calonge MDC, López-Domínguez R, Domínguez-García S, Barrientos-Durán A, Carmona-Sáez P, Rodríguez-Manzaneque JC
03/2020 - Cancers
Autores: Asenjo HG, Gallardo A, López-Onieva L, Tejada I, Martorell-Marugán J, Carmona-Sáez P, Landeira D
03/2020 - Science advances
Autores: Toro-Domínguez D, Villatoro-García JA, Martorell-Marugán J, Román-Montoya Y, Alarcón-Riquelme ME, Carmona-Sáez P
03/2021 - Briefings in bioinformatics
Autores: Carrillo-Gálvez AB, Gálvez-Peisl S, González-Correa JE, de Haro-Carrillo M, Ayllón V, Carmona-Sáez P, Ramos-Mejía V, Galindo-Moreno P, Cara FE, Granados-Principal S, Muñoz P, Martin F, Anderson P
05/2020 - Stem cells translational medicine
Autores: López-Longarela B, Morrison EE, Tranter JD, Chahman-Vos L, Léonard JF, Gautier JC, Laurent S, Lartigau A, Boitier E, Sautier L, Carmona-Saez P, Martorell-Marugan J, Mellanby RJ, Pernagallo S, Ilyine H, Rissin DM, Duffy DC, Dear JW, Díaz-Mochón JJ
02/2020 - Analytical chemistry
Autores: Husi H, Martorell-Marugán J, Tabik S, Benhammou Y, del Val C, Zwir I, Herrera F, Carmona-Sáez P
11/2019 -
Autores: Toro-Domínguez D, Lopez-Domínguez R, García Moreno A, Villatoro-García JA, Martorell-Marugán J, Goldman D, Petri M, Wojdyla D, Pons-Estel BA, Isenberg D, Morales-Montes de Oca G, Trejo-Zambrano MI, García González B, Rosetti F, Gómez-Martín D, Romero-Díaz J, Carmona-Sáez P, Alarcón-Riquelme ME
10/2019 - Scientific reports
Autores: Ramos-Molina B, Sánchez-Alcoholado L, Cabrera-Mulero A, Lopez-Dominguez R, Carmona-Saez P, Garcia-Fuentes E, Moreno-Indias I, Tinahones FJ
07/2019 - Frontiers in genetics
Autores: Requena F, Asenjo HG, Barturen G, Martorell-Marugán J, Carmona-Sáez P, Landeira D
05/2019 - Scientific reports
Autores: Martorell-Marugán J, González-Rumayor V, Carmona-Sáez P
09/2019 - Bioinformatics (Oxford, England)
Autores: Rodríguez-Martínez A, de Miguel-Pérez D, Ortega FG, García-Puche JL, Robles-Fernández I, Exposito J, Martorell-Marugan J, Carmona-Sáez P, Garrido-Navas MDC, Rolfo C, Ilyine H, Lorente JA, Legueren M, Serrano MJ
02/2019 - Breast cancer research : BCR
Autores: Toro-Domínguez D, Martorell-Marugán J, López-Domínguez R, García-Moreno A, González-Rumayor V, Alarcón-Riquelme ME, Carmona-Sáez P
03/2019 - Bioinformatics (Oxford, England)
Autores: Toro-Domínguez D, Martorell-Marugán J, Goldman D, Petri M, Carmona-Sáez P, Alarcón-Riquelme ME
12/2018 - Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
Autores: Alvarez-Cubero MJ, Santiago O, Martínez-Labarga C, Martínez-García B, Marrero-Díaz R, Rubio-Roldan A, Pérez-Gutiérrez AM, Carmona-Saez P, Lorente JA, Martinez-Gonzalez LJ
06/2018 - Scientific reports
Autores: Martorell-Marugan J, Toro-Dominguez D, Alarcon-Riquelme ME, Carmona-Saez P
12/2017 - BMC bioinformatics
Autores: Herrera-Merchan A, Cuadros M, Rodriguez MI, Rodriguez S, Torres R, Estecio M, Coira IF, Loidi C, Saiz M, Carmona-Saez P, Medina PP
10/2017 - Oncotarget
Autores: Carmona-Sáez P, Varela N, Luque MJ, Toro-Domínguez D, Martorell-Marugan J, Alarcón-Riquelme ME, Marañón C
12/2017 - Bioinformatics (Oxford, England)
Autores: Toro-Domínguez D, Carmona-Sáez P, Alarcón-Riquelme ME
03/2017 - Arthritis research & therapy
Autores: Díaz-Villamarín X, Dávila-Fajardo CL, Martínez-González LJ, Carmona-Sáez P, Sánchez-Ramos J, Álvarez Cubero MJ, Salmerón-Febres LM, Cabeza Barrera J, Fernández-Quesada F
08/2016 - Pharmacogenomics
Autores: Melero JT, Ortega FG, Gonzalez AM, Carmona-Saez P, Garcia Puche JL, Sugarbaker PH, Delgado M, Lorente JA, Serrano MJ
03/2016 - Surgery
Autores: Alvarez-Cubero MJ, Martinez-Gonzalez LJ, Saiz M, Carmona-Saez P, Alvarez JC, Pascual-Geler M, Lorente JA, Cozar JM
08/2015 - Experimental & molecular medicine
Autores: Gómez Peña C, Dávila-Fajardo CL, Martínez-González LJ, Carmona-Sáez P, Soto Pino MJ, Sánchez Ramos J, Moreno Escobar E, Blancas I, Fernández JJ, Fernández D, Correa C, Cabeza Barrera J
08/2015 - Pharmacogenetics and genomics
Autores: Toro-Domínguez D, Carmona-Sáez P, Alarcón-Riquelme ME
12/2014 - Arthritis research & therapy
Autores: Vazquez M, Nogales-Cadenas R, Arroyo J, Botías P, García R, Carazo JM, Tirado F, Pascual-Montano A, Carmona-Saez P
07/2010 - Nucleic acids research
Autores: Kökény S, Papp J, Weber G, Vaszkó T, Carmona-Saez P, Oláh E
06/2009 - Anticancer research
Autores: Nogales-Cadenas R, Carmona-Saez P, Vazquez M, Vicente C, Yang X, Tirado F, Carazo JM, Pascual-Montano A
07/2009 - Nucleic acids research
Autores: Vazquez M, Carmona-Saez P, Nogales-Cadenas R, Chagoyen M, Tirado F, Carazo JM, Pascual-Montano A
07/2009 - Nucleic acids research
Autores: Recuero M, Vicente MC, Martínez-García A, Ramos MC, Carmona-Saez P, Sastre I, Aldudo J, Vilella E, Frank A, Bullido MJ, Valdivieso F
04/2009 - Aging cell
Autores: Mejía-Roa E, Carmona-Saez P, Nogales R, Vicente C, Vázquez M, Yang XY, García C, Tirado F, Pascual-Montano A
07/2008 - Nucleic acids research
Autores: Abascal F, Carmona-Saez P, Carazo JM, Pascual-Montano A
05/2008 - Bioinformatics (Oxford, England)
Autores: Anton MA, Gorostiaga D, Guruceaga E, Segura V, Carmona-Saez P, Pascual-Montano A, Pio R, Montuenga LM, Rubio A
01/2008 - Genome biology
Autores: Carmona-Saez P, Chagoyen M, Tirado F, Carazo JM, Pascual-Montano A
01/2007 - Genome biology
Autores: Pascual-Montano A, Carmona-Saez P, Chagoyen M, Tirado F, Carazo JM, Pascual-Marqui RD
07/2006 - BMC bioinformatics
Autores: Chagoyen M, Carmona-Saez P, Gil C, Carazo JM, Pascual-Montano A
07/2006 - BMC bioinformatics
Autores: Hernández-Vargas H, Ballestar E, Carmona-Saez P, von Kobbe C, Bañón-Rodríguez I, Esteller M, Moreno-Bueno G, Palacios J
09/2006 - International journal of cancer
Autores: Carmona-Saez P, Pascual-Marqui RD, Tirado F, Carazo JM, Pascual-Montano A
02/2006 - BMC bioinformatics
Autores: Carmona-Saez P, Chagoyen M, Rodriguez A, Trelles O, Carazo JM, Pascual-Montano A
02/2006 - BMC bioinformatics
Autores: Chagoyen M, Carmona-Saez P, Shatkay H, Carazo JM, Pascual-Montano A
01/2006 - BMC bioinformatics
Información general
Miembros
Publicaciones
Información general
Miembros
Publicaciones
Contenidos
Esta web utiliza cookies
Utilizamos cookies necesarias y opcionales para brindarle la mejor experiencia posible. Haz clic en aceptar para continuar o conocer más en nuestra política de cookies.
Ver política de cookies.Ya has seleccionado tus preferencias sobre cookies en sesiones anteriores. ¿Quieres modificarlas?
Cookies obligatorias
Son aquéllas que permiten al usuario la navegación a través de la página web, y la utilización de las diferentes opciones o servicios que en ella existan como, por ejemplo, identificar la sesión, acceder a partes de acceso restringido, realizar el proceso de compra de un pedido o utilizar elementos de seguridad durante la navegación.
Ver las cookies que utilizamos.Cookies de personalización, análisis o funcionales
Son aquéllas que permiten al usuario acceder al servicio con algunas características de carácter general predefinidas en función de una serie de criterios en el terminal del usuario como por ejemplo serian el idioma, el tipo de navegador a través del cual accede al servicio, la configuración regional desde donde accede al servicio, cuantificar el número de usuarios y así realizar la medición y análisis estadístico de la utilización que hacen los usuarios del servicio ofertado. Para ello se analiza su navegación en nuestra página web con el fin de mejorar la oferta de productos o servicios que le ofrecemos.
Ver las cookies que utilizamos.Las acepto:
Cookies publicitarias o informativas
Son aquéllas que nos permiten la gestión de la forma más eficaz posible de nuestra información, adecuando su contenido a las preferencias del usuario, al tipo de terminal desde el que accede al servicio, a las características del uso que realiza el usuario de los servicios, ofrecerle publicidad propia o de terceros, etc. Para ello analizamos sus hábitos de navegación en Internet para ofrecerle publicidad relacionada con los intereses de sus perfiles de navegación.
Ver las cookies que utilizamos.Las acepto:
Cookies analíticas
Son aquéllas que nos permiten recoger información del uso que se realiza del sitio web.
Ver las cookies que utilizamos.Las acepto: